Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nemp1Q6ZQE4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nemp1Q6ZQE4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms