Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efr3bQ6ZQ18 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efr3bQ6ZQ18 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms