Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smpd4Q6ZPR5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms