Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms