Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shc4Q6S5L9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Shc4Q6S5L9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shc4Q6S5L9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shc4Q6S5L9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms