Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bnip1Q6QD59 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bnip1Q6QD59 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bnip1Q6QD59 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bnip1Q6QD59 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bnip1Q6QD59 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bnip1Q6QD59 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Bnip1Q6QD59 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bnip1Q6QD59 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bnip1Q6QD59 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Bnip1Q6QD59 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bnip1Q6QD59 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bnip1Q6QD59 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bnip1Q6QD59 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bnip1Q6QD59 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bnip1Q6QD59 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bnip1Q6QD59 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bnip1Q6QD59 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bnip1Q6QD59 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bnip1Q6QD59 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip1Q6QD59 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms