Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms