Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF5

Bms1, BMS1 homolog, ribosome assembly protein (Yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bms1Q6PGF5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bms1Q6PGF5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bms1Q6PGF5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bms1Q6PGF5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bms1Q6PGF5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bms1Q6PGF5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bms1Q6PGF5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bms1Q6PGF5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bms1Q6PGF5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bms1Q6PGF5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bms1Q6PGF5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bms1Q6PGF5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bms1Q6PGF5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bms1Q6PGF5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bms1Q6PGF5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bms1Q6PGF5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bms1Q6PGF5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bms1Q6PGF5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bms1Q6PGF5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bms1Q6PGF5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bms1Q6PGF5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms