Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc82Q6PG04 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc82Q6PG04 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms