Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CtifQ6PEE2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CtifQ6PEE2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CtifQ6PEE2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CtifQ6PEE2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CtifQ6PEE2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CtifQ6PEE2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CtifQ6PEE2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtifQ6PEE2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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