Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PdgfrlQ6PE55 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PdgfrlQ6PE55 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms