Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf1cQ6PDZ2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms