Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm2lQ6PDS0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vstm2lQ6PDS0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms