Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM1

Msl1, Male-specific lethal 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl1Q6PDM1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msl1Q6PDM1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msl1Q6PDM1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms