Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlhb9Q6PB60 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bhlhb9Q6PB60 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms