Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gapvd1Q6PAR5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gapvd1Q6PAR5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms