Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo4Q6PAQ4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo4Q6PAQ4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo4Q6PAQ4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rexo4Q6PAQ4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rexo4Q6PAQ4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rexo4Q6PAQ4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rexo4Q6PAQ4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rexo4Q6PAQ4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rexo4Q6PAQ4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rexo4Q6PAQ4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms