Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slf2Q6P9P0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms