Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp12Q6P5B0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp12Q6P5B0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms