Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrimpolQ6P1E7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrimpolQ6P1E7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms