Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Szrd1Q6NXN1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Szrd1Q6NXN1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms