Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Colgalt2Q6NVG7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Colgalt2Q6NVG7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms