Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms