Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ggnbp1Q6K1E7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ggnbp1Q6K1E7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms