Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms