Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm4Q6IRU2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm4Q6IRU2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms