Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt40Q6IFX3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms