Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud6aQ6IE21 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Otud6aQ6IE21 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms