Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nop58Q6DFW4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms