Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6DFW0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6DFW0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6DFW0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q6DFW0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6DFW0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6DFW0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6DFW0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6DFW0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q6DFW0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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