Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp7Q6A4J8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp7Q6A4J8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms