Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdzrn3Q69ZS0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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