Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CltcQ68FD5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CltcQ68FD5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CltcQ68FD5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CltcQ68FD5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CltcQ68FD5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CltcQ68FD5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CltcQ68FD5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CltcQ68FD5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms