Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnna3Q65CL1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms