Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Aebp1Q640N1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Aebp1Q640N1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Aebp1Q640N1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms