Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc18Q640L5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
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Ccdc18Q640L5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc18Q640L5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
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