Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PatjQ63ZW7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms