Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Polr2kQ63871 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms