Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CcncQ62447 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CcncQ62447 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CcncQ62447 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CcncQ62447 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CcncQ62447 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CcncQ62447 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CcncQ62447 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcncQ62447 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcncQ62447 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcncQ62447 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CcncQ62447 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms