Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Epha6Q62413 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha6Q62413 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms