Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tff3Q62395 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms