Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tpd52Q62393 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tpd52Q62393 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms