Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrhQ62361 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrhQ62361 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrhQ62361 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TrhQ62361 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TrhQ62361 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrhQ62361 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrhQ62361 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrhQ62361 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrhQ62361 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrhQ62361 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrhQ62361 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms