Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SypQ62277 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SypQ62277 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SypQ62277 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SypQ62277 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SypQ62277 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SypQ62277 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SypQ62277 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SypQ62277 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SypQ62277 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SypQ62277 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SypQ62277 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SypQ62277 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SypQ62277 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SypQ62277 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SypQ62277 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SypQ62277 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SypQ62277 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SypQ62277 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SypQ62277 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SypQ62277 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SypQ62277 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SypQ62277 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SypQ62277 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SypQ62277 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SypQ62277 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SypQ62277 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SypQ62277 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SypQ62277 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SypQ62277 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SypQ62277 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SypQ62277 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SypQ62277 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SypQ62277 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SypQ62277 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SypQ62277 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SypQ62277 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SypQ62277 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SypQ62277 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SypQ62277 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SypQ62277 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SypQ62277 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SypQ62277 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SypQ62277 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SypQ62277 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SypQ62277 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SypQ62277 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SypQ62277 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SypQ62277 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SypQ62277 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SypQ62277 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SypQ62277 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SypQ62277 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SypQ62277 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SypQ62277 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SypQ62277 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SypQ62277 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SypQ62277 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SypQ62277 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SypQ62277 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SypQ62277 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SypQ62277 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SypQ62277 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SypQ62277 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SypQ62277 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SypQ62277 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SypQ62277 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SypQ62277 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SypQ62277 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SypQ62277 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SypQ62277 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SypQ62277 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SypQ62277 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SypQ62277 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SypQ62277 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SypQ62277 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SypQ62277 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SypQ62277 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SypQ62277 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SypQ62277 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SypQ62277 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms