Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sycp1Q62209 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms