Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SnrpaQ62189 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms