Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttf1Q62187 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ttf1Q62187 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf1Q62187 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms