Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhocQ62159 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RhocQ62159 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhocQ62159 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhocQ62159 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhocQ62159 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhocQ62159 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhocQ62159 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhocQ62159 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms