Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PtafrQ62035 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PtafrQ62035 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtafrQ62035 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms