Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga6Q61739 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms